Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
GRIK4Q16099 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms