Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USF2Q15853 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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