Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNA6Q15825 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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