Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC1Q15751 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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