Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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NME3Q13232 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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NME3Q13232 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
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NME3Q13232 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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NME3Q13232 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NME3Q13232 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NME3Q13232 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NME3Q13232 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NME3Q13232 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NME3Q13232 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NME3Q13232 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NME3Q13232 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NME3Q13232 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NME3Q13232 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NME3Q13232 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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