Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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