Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ACTBP60709 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
ACTBP60709 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
ACTBP60709 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ACTBP60709 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ACTBP60709 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ACTBP60709 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ACTBP60709 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ACTBP60709 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ACTBP60709 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ACTBP60709 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ACTBP60709 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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ACTBP60709 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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ACTBP60709 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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ACTBP60709 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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ACTBP60709 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ACTBP60709 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ACTBP60709 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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ACTBP60709 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ACTBP60709 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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ACTBP60709 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ACTBP60709 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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ACTBP60709 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ACTBP60709 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ACTBP60709 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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ACTBP60709 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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ACTBP60709 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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ACTBP60709 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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ACTBP60709 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ACTBP60709 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ACTBP60709 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ACTBP60709 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ACTBP60709 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ACTBP60709 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ACTBP60709 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
ACTBP60709 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
ACTBP60709 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
ACTBP60709 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ACTBP60709 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ACTBP60709 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ACTBP60709 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ACTBP60709 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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