Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 AC106760.2-201ENST00000504159 619 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ATMINO43313 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ATMINO43313 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATMINO43313 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATMINO43313 AP002833.2-201ENST00000531585 462 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATMINO43313 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ATMINO43313 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATMINO43313 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ATMINO43313 AC092960.1-201ENST00000604762 351 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ATMINO43313 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATMINO43313 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATMINO43313 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATMINO43313 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATMINO43313 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATMINO43313 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATMINO43313 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATMINO43313 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATMINO43313 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATMINO43313 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATMINO43313 ZNF880-202ENST00000422689 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 KAT14-202ENST00000435364 3618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 RSPH14-202ENST00000406876 519 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 AL929410.2-201ENST00000451170 189 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 RN7SL776P-201ENST00000493390 268 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 AC107952.1-201ENST00000524200 376 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 AC079089.1-203ENST00000533300 431 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 LINC02547-201ENST00000531559 3308 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 DAZ1-203ENST00000426000 1846 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATMINO43313 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATMINO43313 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATMINO43313 NCOA4-206ENST00000585056 2124 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATMINO43313 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATMINO43313 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATMINO43313 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATMINO43313 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATMINO43313 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATMINO43313 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATMINO43313 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATMINO43313 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATMINO43313 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATMINO43313 INTS7-203ENST00000366994 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATMINO43313 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATMINO43313 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATMINO43313 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATMINO43313 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATMINO43313 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATMINO43313 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATMINO43313 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ATMINO43313 RN7SKP137-201ENST00000411074 307 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ATMINO43313 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ATMINO43313 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ATMINO43313 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ATMINO43313 RN7SL705P-201ENST00000481678 294 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ATMINO43313 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ATMINO43313 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATMINO43313 SCARNA18.2-201ENST00000516882 84 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ATMINO43313 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms