Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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LRRTM2O43300 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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LRRTM2O43300 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
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LRRTM2O43300 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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