Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TRIM35Q9UPQ4 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 GPNMB-201ENST00000258733 2862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM35Q9UPQ4 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
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