Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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