Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
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