Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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