Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 PPARGC1A-217ENST00000613098 3210 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AL590065.1-201ENST00000603371 4774 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AIG1-209ENST00000629020 3636 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 GARNL3-202ENST00000373387 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 CPNE4-202ENST00000502818 2120 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 DIO2-210ENST00000557010 6367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AKAP5-201ENST00000320636 2601 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AP2B1-221ENST00000621914 5702 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AL049651.2-202ENST00000419734 412 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC012464.1-201ENST00000550687 540 ntTSL 4 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 RND3-201ENST00000263895 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 KPNA6-201ENST00000373625 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 KCNN3-201ENST00000271915 13033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 ZEB2-232ENST00000636026 5172 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 PSMD5-AS1-213ENST00000640327 3531 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC8.02□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 WDR87-202ENST00000447313 9009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 TNFRSF19-203ENST00000382263 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 ZNFX1-202ENST00000371752 7212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 RSPH14-202ENST00000406876 519 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 AC026336.1-201ENST00000466577 351 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 RN7SL306P-201ENST00000492941 296 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 CARSP2-201ENST00000520688 277 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 AC079089.1-203ENST00000533300 431 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 FOXP2-201ENST00000350908 2638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 BCO2-203ENST00000438022 2598 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 AL590705.5-202ENST00000375204 3161 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 MAPK10-207ENST00000395166 3085 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 B4GALT4-207ENST00000467604 5794 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 FYB1-210ENST00000515010 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 TRBV25-1-202ENST00000390398 381 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 FTLP17-201ENST00000432567 525 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms