Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DUSP4Q13115 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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