Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EFEMP1Q12805 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms