Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
ERVV-1B6SEH8 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-1B6SEH8 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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