Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FXNQ16595 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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FXNQ16595 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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FXNQ16595 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
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FXNQ16595 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FXNQ16595 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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