Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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BRD3Q15059 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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BRD3Q15059 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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BRD3Q15059 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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BRD3Q15059 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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BRD3Q15059 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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BRD3Q15059 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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BRD3Q15059 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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BRD3Q15059 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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BRD3Q15059 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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BRD3Q15059 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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BRD3Q15059 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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