Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NME3Q13232 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NME3Q13232 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NME3Q13232 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NME3Q13232 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NME3Q13232 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NME3Q13232 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NME3Q13232 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NME3Q13232 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NME3Q13232 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NME3Q13232 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NME3Q13232 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NME3Q13232 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NME3Q13232 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NME3Q13232 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NME3Q13232 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NME3Q13232 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NME3Q13232 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
NME3Q13232 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NME3Q13232 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
NME3Q13232 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
NME3Q13232 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
NME3Q13232 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
NME3Q13232 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
NME3Q13232 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
NME3Q13232 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
NME3Q13232 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NME3Q13232 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms