Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms