Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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PTPRDP23468 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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