Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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CCDC142Q17RM4 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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CCDC142Q17RM4 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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CCDC142Q17RM4 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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CCDC142Q17RM4 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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CCDC142Q17RM4 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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CCDC142Q17RM4 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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CCDC142Q17RM4 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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