Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
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PTPRRQ15256 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
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PTPRRQ15256 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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PTPRRQ15256 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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PTPRRQ15256 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
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PTPRRQ15256 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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PTPRRQ15256 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
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