Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 TREML3P-201ENST00000457327 501 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 RPS10P14-201ENST00000440748 502 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 MIR8082-201ENST00000612488 81 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NBR1Q14596 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms