Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms