Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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CUL1Q13616 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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CUL1Q13616 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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CUL1Q13616 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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CUL1Q13616 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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