Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
MTMR3Q13615 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms