Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
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