Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.2 ms