Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
ACTBP60709 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ACTBP60709 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ACTBP60709 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ACTBP60709 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ACTBP60709 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
ACTBP60709 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ACTBP60709 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ACTBP60709 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ACTBP60709 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ACTBP60709 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ACTBP60709 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ACTBP60709 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ACTBP60709 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ACTBP60709 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ACTBP60709 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ACTBP60709 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ACTBP60709 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ACTBP60709 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ACTBP60709 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ACTBP60709 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ACTBP60709 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
ACTBP60709 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ACTBP60709 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ACTBP60709 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ACTBP60709 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ACTBP60709 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ACTBP60709 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ACTBP60709 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ACTBP60709 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ACTBP60709 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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ACTBP60709 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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ACTBP60709 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ACTBP60709 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ACTBP60709 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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ACTBP60709 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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ACTBP60709 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ACTBP60709 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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ACTBP60709 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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ACTBP60709 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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ACTBP60709 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ACTBP60709 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ACTBP60709 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ACTBP60709 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ACTBP60709 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ACTBP60709 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ACTBP60709 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ACTBP60709 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ACTBP60709 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ACTBP60709 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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