Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TMIEQ8NEW7 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TMIEQ8NEW7 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TMIEQ8NEW7 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TMIEQ8NEW7 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TMIEQ8NEW7 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TMIEQ8NEW7 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TMIEQ8NEW7 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TMIEQ8NEW7 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TMIEQ8NEW7 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TMIEQ8NEW7 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TMIEQ8NEW7 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TMIEQ8NEW7 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TMIEQ8NEW7 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TMIEQ8NEW7 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TMIEQ8NEW7 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TMIEQ8NEW7 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TMIEQ8NEW7 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TMIEQ8NEW7 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TMIEQ8NEW7 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TMIEQ8NEW7 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TMIEQ8NEW7 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TMIEQ8NEW7 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TMIEQ8NEW7 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TMIEQ8NEW7 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TMIEQ8NEW7 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TMIEQ8NEW7 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TMIEQ8NEW7 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TMIEQ8NEW7 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TMIEQ8NEW7 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TMIEQ8NEW7 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TMIEQ8NEW7 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
TMIEQ8NEW7 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TMIEQ8NEW7 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms