Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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