Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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