Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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