Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F1Q01094 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms