Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 LINC01013-203ENST00000443303 569 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PF4P02776 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PF4P02776 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PF4P02776 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PF4P02776 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PF4P02776 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PF4P02776 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PF4P02776 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PF4P02776 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PF4P02776 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PF4P02776 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PF4P02776 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PF4P02776 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PF4P02776 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PF4P02776 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PF4P02776 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PF4P02776 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PF4P02776 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PF4P02776 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PF4P02776 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PF4P02776 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PF4P02776 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PF4P02776 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PF4P02776 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PF4P02776 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PF4P02776 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PF4P02776 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PF4P02776 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PF4P02776 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PF4P02776 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PF4P02776 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PF4P02776 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PF4P02776 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PF4P02776 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PF4P02776 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PF4P02776 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PF4P02776 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms