Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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