Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP35Q9P2H5 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
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