Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KCNS3Q9BQ31 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms