Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms