Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
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RTL8BQ17RB0 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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RTL8BQ17RB0 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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RTL8BQ17RB0 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
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RTL8BQ17RB0 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
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RTL8BQ17RB0 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
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RTL8BQ17RB0 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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RTL8BQ17RB0 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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RTL8BQ17RB0 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
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