Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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LAMA3Q16787 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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LAMA3Q16787 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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LAMA3Q16787 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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LAMA3Q16787 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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LAMA3Q16787 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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LAMA3Q16787 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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LAMA3Q16787 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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LAMA3Q16787 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
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