Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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DDX39BQ13838 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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DDX39BQ13838 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
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DDX39BQ13838 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
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DDX39BQ13838 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
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DDX39BQ13838 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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DDX39BQ13838 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
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DDX39BQ13838 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
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DDX39BQ13838 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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DDX39BQ13838 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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