Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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TCIRG1Q13488 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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TCIRG1Q13488 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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TCIRG1Q13488 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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