Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
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FOXE3Q13461 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
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FOXE3Q13461 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
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FOXE3Q13461 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
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FOXE3Q13461 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
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FOXE3Q13461 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
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