Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC013283.1-201ENST00000557282 492 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 PSG1-203ENST00000403380 1722 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 CLUL1-201ENST00000338387 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 PPP3R2-201ENST00000374806 3387 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 SPECC1L-207ENST00000541492 3525 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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