Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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