Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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SH3BP4Q9P0V3 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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SH3BP4Q9P0V3 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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SH3BP4Q9P0V3 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
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SH3BP4Q9P0V3 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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SH3BP4Q9P0V3 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
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SH3BP4Q9P0V3 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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SH3BP4Q9P0V3 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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SH3BP4Q9P0V3 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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SH3BP4Q9P0V3 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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SH3BP4Q9P0V3 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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