Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 SCIN-201ENST00000297029 9713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 LAMA2-205ENST00000617695 9678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 SCN8A-201ENST00000354534 11556 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 AC012213.2-201ENST00000562917 4597 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 UNC79-202ENST00000393151 7908 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 ERBB4-205ENST00000436443 12084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 CASR-205ENST00000639785 10047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CSRNP3Q8WYN3 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 430.7 ms